どうやら原因の特定となりそうです。
やっと雨も上がり原因調査再開。
どうもドア側からじゃないのでは？と思っていたので検証。
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ドア側がBピラー側から雨のしずくが伝って結構濡れていた。
ドアパッキン(正式な名前がわからん)とドアの隙間を伝って
あの水たまりまで行ってるんじゃないかと。
やはりボディー側のドアパッキン(正式名称不明)の表面に
濡れた跡があり、ドア側接触面には水滴がついて、ずっと
ドア下部まで回りこんでいました。
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結果としてドアとパッキンを伝い、室内側のたわんで
低くなっている所にたまってしまうようです。
これはパッキンの変形が原因？それともドアが傾いてる？
ドアの開け閉めに違和感は感じないのでやっぱりパッキン？
概ね原因と思われる場所がわかったので何とか対処しようと
思います。